Kvarianská archa Keelah Si'yah se plaví do galaxie v Andromedě a na její palubě se nachází dvacet tisíc kolonistů rozličných druhů včetně drellů, elkorů nebo batarianů. Třicet let před tím, než mají dorazit do cíle, odhalí rutinní prohlídka mrtvé drelly, ležící ve svých kryopodech, a smrtící patogen na palubě. Nákaza se brzy začíná šířit napříč druhy a začne být rychle jasné, že nejde o žádnou nehodu. Je to vražda a její pachatel je stále na palubě.

Lodní systémy jeden po druhém selhávají a mezi kolonisty se šíří panika, neboť virus způsobuje otoky mozku vedoucí k šílenství, halucinacím a strašlivým výbuchům násilí. Pokud se posádce nepodaří lodní technologie opět uvést do chodu a najít lék, Keelah Si'yah do Nexu nikdy nedorazí.